MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM200

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010009	AGT	2	6	10	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010009	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010009	TTA	2	6	118	123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672656
4	NC_010009	TGAT	2	8	128	135	25 %	50 %	25 %	0 %	294672656
5	NC_010009	ACT	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672656
6	NC_010009	AGT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672656
7	NC_010009	ATG	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010009	AAT	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010009	A	8	8	491	498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010009	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010009	T	6	6	530	535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010009	GA	3	6	545	550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010009	TAA	2	6	586	591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010009	ACTA	2	8	637	644	50 %	25 %	0 %	25 %	294672657
15	NC_010009	AT	4	8	648	655	50 %	50 %	0 %	0 %	294672657
16	NC_010009	A	7	7	667	673	100 %	0 %	0 %	0 %	294672657
17	NC_010009	GGC	2	6	688	693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672657
18	NC_010009	T	6	6	708	713	0 %	100 %	0 %	0 %	294672657
19	NC_010009	AAC	2	6	714	719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672657
20	NC_010009	TTCA	2	8	770	777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010009	AAT	2	6	788	793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010009	TA	4	8	804	811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010009	ACA	2	6	815	820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010009	TAT	2	6	825	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010009	T	6	6	865	870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010009	GCGGTT	2	12	923	934	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161376709
27	NC_010009	CGG	2	6	951	956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
28	NC_010009	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
29	NC_010009	ATT	2	6	991	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376709
30	NC_010009	ATTA	2	8	1011	1018	50 %	50 %	0 %	0 %	161376709
31	NC_010009	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376709
32	NC_010009	CGG	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
33	NC_010009	TGG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376709
34	NC_010009	A	7	7	1083	1089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010009	T	7	7	1107	1113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010009	TCAA	2	8	1136	1143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010009	A	6	6	1197	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010009	TC	3	6	1248	1253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010009	AAG	2	6	1385	1390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010009	CAAA	2	8	1505	1512	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010009	GTTT	2	8	1516	1523	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010009	G	6	6	1658	1663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010009	TAT	2	6	1737	1742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010009	CAC	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010009	AGG	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010009	TGCC	2	8	1926	1933	0 %	25 %	25 %	50 %	161376710
47	NC_010009	GA	3	6	2099	2104	50 %	0 %	50 %	0 %	161376710
48	NC_010009	CGA	2	6	2119	2124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
49	NC_010009	GCA	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
50	NC_010009	CAA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376710
51	NC_010009	ACG	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
52	NC_010009	GC	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	294672658
53	NC_010009	CGG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
54	NC_010009	CAT	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672658
55	NC_010009	CCA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672658
56	NC_010009	TGA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
57	NC_010009	AGA	2	6	2580	2585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
58	NC_010009	CGG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
59	NC_010009	AAGAGA	2	12	2871	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
60	NC_010009	CAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
61	NC_010009	CAG	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
62	NC_010009	ACA	2	6	2920	2925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
63	NC_010009	CAG	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
64	NC_010009	GAT	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
65	NC_010009	TC	3	6	2980	2985	0 %	50 %	0 %	50 %	294672658
66	NC_010009	GAAA	2	8	2995	3002	75 %	0 %	25 %	0 %	294672658
67	NC_010009	GAT	3	9	3016	3024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
68	NC_010009	GCA	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
69	NC_010009	AC	3	6	3128	3133	50 %	0 %	0 %	50 %	294672658
70	NC_010009	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
71	NC_010009	CAA	3	9	3274	3282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
72	NC_010009	A	7	7	3342	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	294672658
73	NC_010009	ATA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672659
74	NC_010009	A	7	7	3550	3556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010009	ATT	2	6	3562	3567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010009	GTA	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010009	TA	3	6	3657	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010009	ACA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010009	ATA	2	6	3742	3747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010009	A	8	8	3760	3767	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
81	NC_010009	A	7	7	3781	3787	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
82	NC_010009	AAAT	2	8	3809	3816	75 %	25 %	0 %	0 %	294672660
83	NC_010009	TCA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672660
84	NC_010009	GAA	2	6	3828	3833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
85	NC_010009	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
86	NC_010009	TTG	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
87	NC_010009	ATT	2	6	3979	3984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
88	NC_010009	AAC	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672660
89	NC_010009	TTA	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
90	NC_010009	AGA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
91	NC_010009	TAA	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
92	NC_010009	TGT	2	6	4091	4096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
93	NC_010009	GAT	3	9	4098	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672660
94	NC_010009	GCA	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672660
95	NC_010009	A	6	6	4168	4173	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
96	NC_010009	CTT	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672660
97	NC_010009	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
98	NC_010009	TTA	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
99	NC_010009	TAT	2	6	4292	4297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
100	NC_010009	AAGTT	2	10	4321	4330	40 %	40 %	20 %	0 %	294672660
101	NC_010009	ATT	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
102	NC_010009	A	6	6	4367	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
103	NC_010009	A	7	7	4391	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
104	NC_010009	T	7	7	4416	4422	0 %	100 %	0 %	0 %	294672660
105	NC_010009	AAT	2	6	4423	4428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
106	NC_010009	T	6	6	4460	4465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010009	T	7	7	4477	4483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010009	TC	3	6	4594	4599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010009	TAT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010009	TAT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010009	TTA	2	6	4615	4620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010009	T	7	7	4658	4664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010009	A	7	7	4670	4676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010009	A	7	7	4691	4697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010009	A	7	7	4726	4732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010009	TCAA	2	8	4737	4744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010009	AGT	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010009	CCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672661
119	NC_010009	TAG	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
120	NC_010009	TGT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
121	NC_010009	GTT	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
122	NC_010009	TATG	2	8	4890	4897	25 %	50 %	25 %	0 %	294672661
123	NC_010009	T	6	6	4960	4965	0 %	100 %	0 %	0 %	294672661
124	NC_010009	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
125	NC_010009	T	6	6	5134	5139	0 %	100 %	0 %	0 %	294672661
126	NC_010009	TAAA	2	8	5156	5163	75 %	25 %	0 %	0 %	294672661
127	NC_010009	ATC	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672661
128	NC_010009	TTC	2	6	5226	5231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
129	NC_010009	ATA	2	6	5241	5246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672661
130	NC_010009	T	6	6	5247	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	294672661
131	NC_010009	AGT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
132	NC_010009	ATTT	2	8	5339	5346	25 %	75 %	0 %	0 %	294672661
133	NC_010009	TAA	2	6	5451	5456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010009	T	7	7	5479	5485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010009	AAT	2	6	5519	5524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010009	ATT	3	9	5579	5587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010009	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010009	TTC	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010009	CTT	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010009	TCTTTT	2	12	5753	5764	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_010009	AT	3	6	5774	5779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010009	GAT	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010009	A	6	6	5873	5878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010009	ATT	2	6	5886	5891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.